El museo nace el 8 de septiembre de 2013 con su primera estación en la comuna de Recoleta. Nuestra colección partió siendo no más de 20 piezas de exhibición entre maquetas, vestuarios y objetos. Al año siguiente 2014, incrementamos nuestra colección en casi 45 piezas, teniendo importantes donaciones como vestuarios con una data de 70 años. Ya para el 2015 pudimos materializar nuestra carpa-museo, la que nos permite actualmente itinerar de mejor manera con la colección. A esto se agregan productos que hoy en día dan una particularidad a nuestro que hacer como son: narrativas del circo chileno, talleres patrimoniales de maquillaje de payaso, cartelera circense. El museo ha tenido que indagar, crear y probar estrategias para dinamizar su espacio y propuesta de visita, haciendo de la permanencia en el museo, algo atractivo y educativo a la vez.
El 2017 se funda la Fundacion Museo del Circo Chileno y como personalidad jurídica a cargo de la figura Museo itinerante del Circo Chileno, obtiene el 2018 un fondo para infraestructura e itinerancia. Pasando por primera vez su colección por procesos de restauración preventivas y exhibición en vitrinas diseñadas para protección de las piezas. Este fondo además permitió renovar el material de itinerancia, pudiendo adquirir una nueva carpa (marquesina de 14x8), impermeable y de confección de alto standard como es la fábrica Carrousel.
Para el 2019 pudimos gracias a recursos del Fondo de Mejoramiento de Museos 2019, implementar el proyecto de movilidad del Museo del Circo denominado "Carros de Circo". el que consiste en dotar al Museo de 3 carros de 6 metros de largo, acondicionados en su interior como salas móviles de exhibición. Este proyecto permitirá a nuestra institución llegar con nuestra muestra a cualquier espacio y localidad.