El origen del Museo Regional de Iquique (MRI) se remonta a 1935 cuando el IFOM tras la depresión salitrera busca impulsar la economía regional, para ello durante la Semana Tarapaqueña inaugura el 1er Museo Regional de Arqueología, Paleontología y Minerales. El MRI se crea formalmente para resguardo del acervo del Norte Grande el 6 de noviembre de 1960 por la UCN y profesores del Liceo de Hombres, siendo su primer Director don Julio Romero (1960-1965), le seguirá el museógrafo don Jorge Checura Director (1965-1979).
El Dr. Horacio Larraín, Antropólogo-Arqueólogo (Director 1970-1973) dará al MRI una línea científica, en un Chile que vivía un proceso social interesado en la identidad y pasado de sus pueblos. El alentará a Jorge Checura a estudiar Museología en México, quién retornará y dará grandes aportes a la investigación del pasado regional destacando el hallazgo del Santuario Inca de C° Esmeralda e investigaciones en el litoral.
Dina Medvinsky (Directora 1979-1981), Conservadora Textil, analizará, sistematizará y catalogará las colecciones y verá el traspaso UCN al Municipio.
Octavio Morales (Director 1982-1989), asume desde el traspaso a CORMUDESI y traslado desde ex EFE al Ex Palacio de Tribunales de Iquique en 1986.
Cora Moragas Wachtendorff, Arqueóloga, Directora del MRI (1991-2001) y de la Oficina Regional del CMN, impulsará e integra una nueva arqueología regional.
El Director Patricio Muñoz (2001-2003) orientará el MRI a la ciudadanía y turismo, hasta la Dirección de Francisco Téllez, Arqueólogo (2003-2006 y 2011-2015♰) juntos crean la nueva sala Colección Isluga.
La Historiadora Orietta Ojeda (2007-2010), gestionará la Sala C° Esmeralda y su conservación preventiva, crea la web del MRI.
El 2019 la Dirección de Luis Pérez Reyes, Arqueólogo-Paleontólogo, reforma y restaura el MRI, crea Deptos. de Conservación-Restauración, Historia y Archivo Histórico, Ingreso y Catalogación, Educación y comunidades, Administración y crea depósitos por tipo de materialidad.